Software a la medida

Es complicado, ya que primero tienes que evaluar las horas que se tradaráen preparar las especificaciones de que tiene que hacer el software y como.
Luego evaluar las horas en hacer este software y esto es difícil, porque cada programador programa de forma diferente.
Luego también se complica cuando se tiene que evaluar la fase de pruebas en cuanto el número de horas.
Y para terminar, ¿a qué precio/hora pones este trabajo? Porque según el software, deberá haber un director/coordinador.

Siento no serte de gran ayuda, pero no es un campo que yo toque. De todas maneras, supongo que sera básicamente hacer un estudio personalizado de que necesidades tiene la empresa, exponérselo a un analista y que este investigue que tipo de programación le puede hacer falta, programadores etc.

Aquí hay vínculos sobre el tema, aunque no exactamente "costos" esto depende de diversos factores del programador y empresa:
http://mvpfiles.spaces.live.com/blog/cns!44A6F6B3589906F1!1489.entry
http://gfranklin.iespana.es/tesis/resumentot.pdf
http://www.unab.edu.co/editorialunab/revistas/rcc/pdfs/r21_art6_c.pdf
http://es.wikipedia.org/wiki/Software

Tal como lo planteas es imposible saber nada, es como si dijeras "costos sobre hacer una casa", no solo tienes que saber los precios de las horas y del personal que se necesita, sino también necesitas saber que software vas ha desarrollar.