Te pongo una lista de cosas que pueden causar el problema que comentas pero tengo una duda, ¿el aire de donde los has vaciado?
Normalmente cuando se cambian los filtros de un equipo de ósmosis hay que hacer un lavado desconectando el tubo que va hacia la membrana, esto es porque estos filtros contienen carbon activo y el agua que sale en los primeros litros contiene una gran cantidad de carbon disuelto en ella. Si todo ese carbon entra en la membrana de la ósmosis la puede obstruir y puede pasar lo que indicas.
Otra de las comprobaciones que debes hacer es que tengas el agua de entrada a la ósmosis abierta y también que hayas abierto la llave que deja entrar el agua al deposito.
Por ultimo si el equipo es con bomba debes tener enchufado correctamente el transformador a la corriente tanto el lado del enchufe como el conector que va a la ósmosis.