Baja medica y devolución de cuota de SS

Mi novia tiene un problema por lo que la tienen que dar la baja de vez en cuando, aunque siempre por pocos días (una semana la vez que más tiempo le dieron). Durante los primeros días no cobra nada, se que eso es así, pero además, y aquí viene la duda, le descuentan de su salario lo correspondiente a la SS de esos días, y si además coge un fin de semana, también la SS del fin de semana. Quería saber si la empresa puede descontarte la SS de los días de baja.