Baja laboral de un socio al 33%

Es la primera vez que nos pasa, somos una sociedad limitada de 3 socios, los seguros de autónomos los paga la sociedad, y ahora uno de los socios está de baja, ¿esa prestación debería de repercutir a la sociedad puesto que es la que paga los autónomos? ¿O debe de cobrarla el socio afectado y no cobrar nomina?

¿Me podrían orientar para futuras ocasiones que nos pase lo mismo?