Manchado color marrón en la menstruación

Quiero empezar diciendo que mi novia tuvo manchado color marrón durante su menstruación, pero nunca ca sangre, pensábamos en un principio que quizás estaba embarazada, pero a los 8 se hizo una prueba de embarazo y dio negativo, a lo 11 días se hizo otra y otra vez negativo, ya finalmente hoy se hizo otra a los 15 del acto sexual y nueva vez dio negativo, la pregunta es ¿ya puedo estar TRANQUILO? Es que no deseamos un embarazo ahora, o ¿habría qué seguir realizando pruebas?, y si con esas tres es suficiente, entonces ¿cuál seria la causa de esas manchas Marrones?

Nota: antes, durante y después de su periodo menstrual ella estuvo muy estresada y asustada.