Contradicción en escrituras, Registro de Propiedad y Ayuntamiento

Heredé dos pisos que tienen mas de 60 años, los cuales en el Ayuntamiento pagan servicios independientes, también tienen energía eléctrica individual. Me encuentro ahora con un problema y es que en el Registro figura solamente uno de 60 metros siendo 100 la realidad. En catastro y escrituras figuran como son en realidad, dos de 50 cada uno. Me dicen que lo primero es adaptar a la realidad los metros. Un colindante puede oponerse sin motivo justificado, ¿no afectándole y teniendo certificación catastral y certificación municipal de que es así desde hace 60 años?