Cuando cojo la baja estando de noche por operación quirúrgica?

El lunes entro ha trabajar a las 22:00 y Salgo el martes a las 06:00 de la mañana, me operan el martes 08:30, mi pregunta tengo que ir el lunes a las 22:00 hasta las 00:00 cuando se cursa la baja desde las 00:00 hasta las 24:00, haber estoy perdido aquí yo no quiero ir a trabajar el lunes hasta las 6 de la mañana martes, puedo coger la baja el martes no ir el lunes y que me descuente las dos horas desde la 22:00 hasta las 00:00 del lunes,¿? ¿Cómo funciona esto?