Primero, usarcloro sin ajustar el PH puede no servir para nada pues el cloro, para realizar correctamente su función, debe tener el PH entre 7,2-7,6.
Segundo, ¿qué tipo de cloro estas a usar? Si estas usando tricloro en pastillas o dicloro (cloro choque) granulado, estos dos compuestos tienden a bajar el PH y además contienen ácido isocianúrico que, aunque necesario, tienes que tenerlo controlado sobre 30ppm, porque si no puede causarte problemas en el control de la piscina, Este parámetro, al igual que la alcalinidad, hay que tenerlo controlado y medirlo habitualmente. Mejor usa hipoclorito sódico liquido (lejía, clorandina, lavandina...), pues este tiende a hacer subir el PH y para bajarlo, en caso necesario, se puede usar ácido clorhídrico (salfumant, agua fuerte, ácido muriático...).
Tercero, para controlar el PH resulta fundamental controlar la alcalinidad. Esta ha de estar sobre 100ppm para que el PH no fluctúe mucho. En este enlace te lo explican:
http://www.hablemosdepiscinas.com/foro/viewtopic.php?f=9&t=705
Cuarto, al usar agua de pozo/manantial se corre el riesgo de que la misma tenga altas concentraciones de hierro, cobre, etc. Para eliminarlos hay que seguir un proceso que fuerce su decantación para su posterior envío al desagüe. En este enlace te explican el proceso a seguir. Leételo en profundidad para saber como actuar:
http://hablemosdepiscinas.com/foro/viewtopic.php?f=10&t=14