El ejemplo no me parece que ayude mucho, con respecto al enunciado de la pregunta.
Para no complicarlo mucho supongamos que tenemos una carpeta de nombre "Hola" y que queremos albergarla como subcarpeta de otra ya existente con ese mismo nombre. Obviamente el path de la carpeta que se quiere mover tiene que ser distinto del path de la carpeta destino, porque en caso contrario no podría existir una de ellas. Digamos, por tanto, que el path de la que se quiere mover es c:\tmp\hola y el de la carpeta de destino se c:\prueba\hola. Querríamos, por tanto, que la carpeta c:\tmp\hola pase a estar en c:\prueba\hola\hola. Creo que para eso bastaría con el comando:
xcopy "c:\tmp\hola\*.*" "c:\prueba\hola\hola\*.*" /D /S /Y /I /H
Pongo el origen y el destino entrecomillados para salvar la posibilidad de que en el caso real los nombres de las carpetas o sus paths tuvieran espacios. Si quieres incluir este comando en un bat no habrá problema