¿Fujifilm Z5fd o F40fd?

Quizá las muestras fotográficas que has visto no eran realmente comparables... por ejemplo, a sensibilidades ISO bajas suele ser más difícil notar la diferencia de rendimiento ISO, especialmente entre cámaras de la misma marca y de básicamente el mismo tipo (en este caso, compactas de bolsillo); también es posible que hayas comparado muestras de la F40fd a sensibilidades ISO altas con muestras de la Z5fd a sensibilidades más bajas. O quizá incluso hayas comparado muestras de la F40fd realizadas con el máximo diafragma (lo que suele producir mayor difracción, aberraciones cromáticas, etc.) frente a muestras de la Z5fd tomadas (por casualidad, ya que en realidad ninguna de las dos máquinas permite elegir este ajuste) con su diafragma óptimo para nitidez (el llamado en inglés "sweet spot"), que imagino estará en torno a f/4.5.
Porque lo cierto es que la F40fd sí es significativamente superior, en todos los aspectos que comentas, a la Z5fd. Esta última tiene una óptica "plegada" (las lentes se extienden en el interior del cuerpo de la cámara, en un ángulo de 90 grados respecto al eje del objetivo externo), y este tipo de ópticas tienen inherentemente menos calidad potencial que las ópticas normales que se extienden por fuera de la cámara, como la de la F40fd: presentan menos nitidez en toda la foto (particularmente en las esquinas), mayor grado de aberraciones cromáticas, mayor dispersión de luz (es decir, menor capacidad de contraste), y no pocas veces también mayor distorsión de barril; amén de que, como tú mismo has podido ver, suelen tener menos luminosidad, por lo menos en angular.
El tamaño del CCD también es importante; aunque el de la F40fd no está óptimamente aprovechado (hasta el punto de que las F30 y F31fd, con un sensor un poquito más pequeño, tienen sin embargo un rendimiento ISO algo superior), sigue siendo sobradamente más grande que el pequeño sensor de la Z5fd (y de toda la serie Z), y real y verificablemente, puede obtener más calidad fotográfica, a una misma sensibilidad ISO, lo que significa que es más apta para escenarios poco iluminados en los que no puedas usar ni el flash ni un trípode.
Por otro lado, las tarjetas xD no son más rápidas que las SD: es al contrario, las SD son mejores en prácticamente todos los sentidos: capacidad de almacenamiento, potencia, precio, compatibilidad y popularización...
Así pues, y a menos que necesites la miniaturización adicional de la Z5fd, realmente te recomiendo con muy pocas dudas optar por la F40fd; de hecho, si puedes echa un vistazo a la F50fd, que tiene numerosas mejoras interesantes. Pero si por lo que sea no te convence, entonces sin duda la F40fd por encima de la Z5fd.

Fujifilm FinePix F40fd:
http://www.quesabesde.com/noticias/fuji-finepix-f40fd,1_2888
http://www.dcresource.com/reviews/fuji/finepix_f40fd-review/index.shtml
http://www.digitalcamerainfo.com/content/Fujifilm-F40fd-Digital-Camera-Review-13027.htm
http://www.trustedreviews.com/digital-cameras/review/2007/06/05/Fujifilm-FinePix-F40fd/p1
http://www.megapixel.net/reviews/fuji-f40/f40-gen.php
http://www.photographyblog.com/reviews_fujifilm_finepix_f40fd.php
http://www.steves-digicams.com/2007_reviews/fuji_f40fd.html
http://www.digicamreview.co.uk/fujifilm_finepix_f40fd_review.htm
http://www.digitalcamerareview.com/default.asp?newsID=3144
http://dc.watch.impress.co.jp/cda/review/2007/03/08/5629.html
http://dc.watch.impress.co.jp/cda/review/2007/04/10/6004.html
http://www.pocket-lint.co.uk/reviews/review.phtml/2349/3373/fujifilm-finepix-f40fd-digital-camera.phtml
http://www.thinkcamera.com/news/article/mps/UAN/442/v/1/sp/
http://www.digitalkamera.de/Testbericht/Fujifilms_FinePix_F40fd_zeigt_ihr_Profil_im_digitalkamera_de_Test/4217.aspx
Fujifilm FinePix Z5fd:
http://www.quesabesde.com/noticias/fuji-finepix-z5fd,1_2801
http://www.imaging-resource.com/PRODS/FPZ5/FPZ5A.HTM
http://www.trustedreviews.com/digital-cameras/review/2007/04/03/Fujifilm-FinePix-Z5fd/p1
http://dc.watch.impress.co.jp/cda/review/2006/12/06/5104.html
http://dc.watch.impress.co.jp/cda/review/2006/12/08/5187.html