Estas confundiendo la covarianza muestral con el sumatorio de los (x·y) y la varianza muestral con el sumatorio de los x^2 o y^2.
La auténtica fórmula es (llamando ro a r que es lo habitual)
$$\begin{align}&\\ &\rho= \frac{S_{xy}}{\sqrt{S_x^2} \sqrt{S_y^2}}\\ &\\ &\\ &\text{o más abreviado y claro}\\ &\\ &\rho= \frac{S_{xy}}{S_xS_y}\\ &\\ &\\ &donde\\ &\\ &S_{xy}=\frac{\sum_{i=1}^n (x_i-\overline x)(y_i-\overline y)}{n-1}=\\ &\\ &\frac{\sum_{i=1}^n x_iy_i-\overline x\sum_{i=1}^n y_i- \overline y \sum_{i=1}^n x_i+n\overline x \overline y}{n-1}=\\ &\\ &\\ &\frac{\sum_{i=1}^n x_iy_i-n\overline x \overline y- n\overline y \overline x+n\overline x \overline y}{n-1}=\\ &\\ &\\ &=\frac{\sum_{i=1}^n x_iy_i-n\overline x \overline y}{n-1}\\ &\\ &\\ &\\ &S_x= \sqrt{\frac{\sum_{i=1}^N (x_i-\overline x)^2}{n-1}}=\\ &\\ &\\ &\sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n x_i^2-\overline x \sum_{i=1}^n x_i-\overline x \sum_{i=1}^n x_i+ n\overline x \overline y}{n-1}}=\\ &\\ &\sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n x_i^2-2n\overline x \overline x+ n\overline x^2}{n-1}}=\\ &\\ &\sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n x_i^2-n\overline x^2}{n-1}}\\ &\\ &Analogamente\\ &\\ &Sy = \sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n y_i^2-n\overline y^2}{n-1}}\\ &\\ &\\ &\text{con ello queda}\\ &\\ &\rho = \frac{\frac{\sum_{i=1}^n x_iy_i-n\overline x \overline y}{n-1}}{\sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n x_i^2-n\overline x^2}{n-1}} \sqrt{\frac{\sum_{i=1}^n y_i^2-n\overline y^2}{n-1}}}=\\ &\\ &\\ &\frac{\sum_{i=1}^n x_iy_i-n\overline x \overline y}{\sqrt{\sum_{i=1}^n x_i^2-n\overline x^2} \sqrt{\sum_{i=1}^n y_i^2-n\overline y^2}}\\ &\\ &\\ &\\ &\end{align}$$
Que si lo ponemos con la misma notación que usé antes, sin subíndices y todo en función de los sumatorios es:
$$\begin{align}&\rho=\frac{\sum xy-n \frac{\sum x}{n}·\frac{\sum y}{n}}{\sqrt{\sum x^2-n\left( \frac{\sum x}{n} \right)^2} \sqrt{\sum_{i=1}^n y_i^2-n\left( \frac{\sum y}{n} \right)^2}}=\\ &\\ &\\ &\frac{\sum xy-\frac{(\sum x) (\sum y)}{n}}{\sqrt{\sum x^2- \frac{(\sum x)^2}{n}} \sqrt{\sum y^2- \frac{(\sum x)^2}{n}}}\\ &\end{align}$$
que es lo mismo que salió entonces y luego las cuentas son las mismas y el resultado es el mismo.
Además esto me ha servido para darme cuenta de una cosa: existen las medidas poblaciones para la varianza, desviación y covarianza que son las que se divide por n y las medidas muéstrales que son las que se divide por n-1. Bien pues, el indice de correlación da lo mismo que se calcule con unas o con otras, siempre que no se mezclen.
En resumen que tenias una confusión pensando que las S esas significaban sumatorios y son otra cosa.
Y eso es todo.