Impuesto: Transmisiones patrimoniales onerosas

Hola.
Mi duda es la siguiente:
Teníamos un piso al 50% entre mis hermanos y yo por un lado, y mi tío por otro lado. Ahora, le hemos comprado a mi tío su parte (su 50%). En su momento se hizo la autoliquidación de transmisiones patrimoniales onerosas, dando como resultado el pago de 1.081,80 Euros. Ahora, la oficina liquidadora correspondiente nos envía el proyecto de liquidación resultando una cuota tributaria de 1.361,50 Euros. Con lo cual sale una diferencia a pagar de 279,70 Euros. Mi pregunta es la siguiente: Dado que la compra se realiza por la mitad de la vivienda y no por el 100% de ésta, ¿el impuesto de transmisiones no debería ser por la mitad del precio (calculado en base a las tablas que esta oficina liquidadora utiliza para calcular el total) de la vivienda?
Aclaro que en la documentación recibida no he visto por ningún sitio que se trate de cálculos por el 50% del valor de la vivienda.
Muchas gracias por anticipado.