Accidente en itinere ¿Cobraré mi sueldo integro?

La semana pasada tuve un accidente con el coche cuando iba al trabajo. Fue una colisión trasera. Fui a urgencias, me dijeron que era un latigazo cervical ( me pusieron collarín) y me mandaron a la mutua del trabajo directamente. En la mutua aunque no me prestaron mucha atención me dieron la baja, y en el día de hoy he empezado rehabilitación, a pesar de que me sigue doliendo bastante y tengo mareos. Me surgen dos dudas: ¿Cobrare mi sueldo con normalidad este mes? ( La baja me la dieron desde la mutua el día del accidente y Mi convenio laboral es de teleoperadores o telemarketing o algo así). Mi otra duda es que todo el mundo me dice que me tienen que indemnizar al ser el otro vehículo el que me alcanzo por detrás. ¿Cómo funciona esto de la indemnización? ¿Depende del tiempo que este de baja? ¿Y si me dan de alta, aunque siga acudiendo al fisioterapeuta? ¿Tengo qué hacer alguna gestión extra con mi compañía de seguros, o ya lo tramitan ellos? Muchas gracias por adelantado, aunque son muchas las preguntas que os hago.