Sueldo tras la baja

Buenas tardes,

Trabajo en una pastelería desde hace casi 11 meses. El día 5 de este mes me dieron de baja por un esguince de rodilla, hasta hoy que ya pedí el alta. La baja no me la han puesto laboral, pero el medico de cabecera y el de la mutua me dijo que lo tendrían que haber puesto laboral. Me ha estado mirando también la mutua porque dicen que ellos pagan mi baja. Quería saber si me van a descontar algo en el sueldo y si es así cuanto. Espero que no porque ni siquiera me paga por convenio, cobro menos de lo que me corresponde.

Gracias, un saludo.