El programa a elegir va a depender mucho de cada uno, de lo que necesites en el trabajo, cada uno tiene sus ventajas e inconvenientes, siento no poder ayudarte más en ese sentido (darte un nombre concreto).
Sí te aconsejo es que busques concienzudamente y previamente te descargues demos gratuitas puesto que el funcionamiento varía muchísimo entre unos y otros. Datos importante son el contenido de alimentos que tenga, si te permite añadir otros nuevos, la facilidad para ir elaborando las dietas, etc.
El trabajo manual es posible, pero vas a tardar muchísimo en hacer una dieta, date cuenta que tendrías que hacer todos los cálculos de macro y micronutrientes y eso a mano es una tortura!