¿Pregunta sobre particiones?

Saludos ...
¿Si tengo por ejemplo un disco duro de 40gb y deseo hacer 2 parts verdad que la partición donde va a estar definida la unidad c (donde van a estar instalaogramas)es recomendable que sea mayor a la otra partición?
¿Si voy a partionar el diue partición debe ser mayor y por que?
Gracias ...