Creo haberte entendido bien, y hay solución para lo que buscas. En primer lugar, no puedes evitar que las ventanas adicionales (técnicamente popups)se abran, ya que la visualización de una página web se basa en la ejecución de una serie de instrucciones, entre las cuales están abrir tal o cual ventana. Si detenemos así la apertura de la página web que no nos interesa, detendremos también el resto de las instrucciones y no podremos ver la página web en cuestión.
La solución radica en instalar un programa residente en memoria, es decir que hay que cargar preferiblemente antes del explorador, que al detectar la apertura de una nueva ventana, compare con una lista de páginas "prohibidas" y la cierre. Este sistema al, principio es un poco pesado, puesto que tienes que ir metiendo las páginas a eliminar (aunque ya trae algunas predefinidas), pero a la larga, a medida que el programa va "aprendiendo" es el más efectivo y útil.
Así pues tienes que buscar programas anti popups. Yo te voy a recomendar uno, el Popup Killer, que para mi es muy bueno. La versión actual es Shareware, pero existe una versión un poco anterior que es freeware, y para el propósito que nos ocupa es más que suficiente: se trata de la versión 1.7. Como no podrás descargarla de la página oficial -creo que ya la han quitado- descárgala de:
http://download.guiasoft.com/1900/1833/2156/puk17setup.exeAprovecho, para decirte que si alguna vez necesitas una versión anterior de un programa y ya no esta en la página oficial buscala en:
http://software.latinguia.com/ donde conservan varias versiones del programa, eso si, no hay muchos programas...
Al margen de lo anterior, puedes buscar más programas anti popups en Softonic (www.softonic.com) o en páginas en ingles como Tucows (www.tucows.com) o Download.com (www.download.com)
Prueba y dedide el que más te guste.