Se debe a varias posibles causas, por ejemplo un virus
http://www.pcactual.com/articulo/zona_practica/consultas/consultas_software/13207/virus_ataca_menu_del_boton_derecho_raton.html
http://forum.kaspersky.com/index.php?showtopic=241178
Un método bajo Windows sólo por investigar: Nos dirigimos a la barra de tareas, pulsamos boton derecho, entramos a "Propiedades >> Menu inicio >> Personalizar", y entre las opciones encontramos la opción "Permitir los menús contextuales y arrastrar y colocar", la marcamos si estuviera desmarcada.
Para poder realizar el clic derecho en el paso anterior, podemos usar una tecla del teclado, dicha tecla es la que está situada entre la tecla de Windows y control derecho
Tambien se puede conseguir con esta otra combinación.
http://www.ehowenespanol.com/clic-derecho-usando-teclado-como_44694/
La utilización de esta tecla es un 'apaño' pero puede sacarnos de un problema puntualmente.
Otra forma de salir del paso, algo más compleja, es usar un programa de Macros (pulsaciones predefinidas), de tal manera que por ejemplo, sea posible que al pulsar el botón izquierdo del ratón dos veces seguidas (o dejándolo pulsado), esto sea equivalente a pulsar el botón derecho, o mejor aún, que pulsar la rueda del ratón sea equivalga a pulsar el botón derecho.
Desconozco en gran medida estos programas pero puedes probar con Easy Macro Recorder.
http://www.techspot.com/downloads/2019-easy-macro-recorder.html
En el caso de que el ratón tenga un fallo físico o real en el botón, puedes seguir algún tutorial para abrirlo e intentar averiguar que le ocurre, a veces es el cable el causante, o una rotura interna del plástico o almohadillas.
http://www.youtube.com/watch?v=sHgLVrFFVwY