¿Tengo 54 días de retraso de mi periodo y en los exámenes no sale nada que puede se?

Buenas tarde:

Mi ciclo a sido bien regular como reloj, El ultimo mes fue 05 de agosto y si dentro de los días fértiles tuve relaciones sin protección me he realizado test de sangre y nada el doctor me dijo que puede ser quiste pero mi eco esta limpia un poco inflamado el útero nada más.

¿En estos mese he tenido un flujo pequeño de liquido café o marrón duro como 3 días del mes de septiembre pero nada más y en mi vientre una punzada que sera? Me puede aconsejar