No sé si he entendido bien tu pregunta. Tu lo que quieres es ingresar el dinero en la hipoteca y no en la cuenta pata que se lo chupe el préstamo, ¿no?
El préstamo tiene una numeración que es al mismo tiempo un número de cuenta, tu puedes ingresar directamente en el préstamo hipotecario sin pasar por ninguna cuenta bancaria. El día de pago de la hipoteca vas a la sucursal, que no tiene por qué ser la tuya y dices quieres pagar tu hipoteca por ventanilla y le das ese número de préstamo, y le específicas que lo quieres en esa cuenta del préstamo directamente y no en la cuenta corriente. Ahí empezarán las pegas, pero dependerá de lo estricto que te pongas, si no consigues que se haga como tu quieres, en ese mismo momento (lo puedes llevar ya preparado de casa) entregas una reclamación a atención al cliente con dos copias, que te sellen la tuya, donde especifique que el Banco se niega a permitir pagar tu préstamo y al mismo tiempo entregas una solicitud de cancelación de la cuenta corriente, donde incluyas que a partir de esa fecha no serás responsable de los gastos o comisiones que se deriven de la misma. El hecho de pagar un préstamo a través de una cuenta corriente es por operativa y beneficio del Banco, pero no tienes obligación de tener una cuenta sino quieres, ya que puedes pagar el préstamo por ventanilla. También puedes enm incluso pedir hojas de reclamación a consumo. La cuestión es hacer ruido y ser una mosca cojonera
Léete este link, es muy interesante
http://www.elconfidencial.com/vivienda/2013-06-23/que-no-te-enganen-la-cuenta-destinada-al-pago-en-exclusiva-de-la-hipoteca-no-tiene-comisiones_194124/