Pues no se que clase de pintura nueva sera que según creo entender rellena la fisura y después aplicas mortero ¿no? Existen los llamados pinturas de revestimiento para fachadas que son al agua, después la impermeables (elásticas) que pueden ser al agua o de poliuretano, después existen otras empresas químicas que hacen una como si fuera la de revestimiento de fachadas siendo impermeables y un poco menos elástica siendo con acabados rugosos si lo deseas, como con arena por decirlo de algún modo y por ultimo el mortero monocapa menos impermeables y no elásticos.
No se cual sera esa nueva pintura, estas no creo que sean ya que pudiera tapar la grieta si es pequeña pero con el problema que después supone aplicar mortero producto rígido.
Yo no se la pintura que comentas pero una opción sería utilizar una silicona o sellante impermeable que existe de poliuretano, como los que se utilizan en fachadas, terrazas, etc.. tienen buena elasticidad, agarre, etc.. eso si limpiar de polvo para que coja bien, después aplicar mortero o hasta incluso pintar.
Espero que si te enteras de dicho producto lo comentes.
Saludos
Pdta. Si no te refieres a que la pintura rellena la grieta y solo es aplicar mortero nuevo sobre, mortero viejo, eso son productos que algunos los llaman de puente de union, con base al algua, para diluir o preparados al uso (aplicar ya directo) incoloros, es para que se fije bien lo que son soportes viejos con los nuevos.