Por qué me sucede esto con la píldora anticonceptiva?

Veréis, hace un mes empecé a tomar la píldora anticonceptiva, tal y como me lo recomendó mi ginecóloga, cada día a la misma hora y desde el primer día de la regla, el caso es que al terminar los 21 días tomándola, a los dos días me bajó una especie de regla, más oscura y en mucha menor cantidad. Durante este mes mantuve relaciones sin condon con mi novio ya que la píldora, si la tomaba el primer día de la regla, me protegería. El caso es que no se a que se debe esta regla tan extraña, he leído que probablemente sea por el cambio hormonal.