¿A que se debe el flujo marrón?

Hace como 2 meses tuve relaciones sin protección con mi enamorada y utilizó la pastilla del día después, esperábamos la regla el 3 de Octubre pero le llegó el 23 del mismo mes, o sea que se le atrasó. El 6 de noviembre hubo penetración por 10 segundos sin condón. El día 7, 8 y 9 mi enamorada ha tenido un flujo marrón. ¿Me tiene un poco asustado a que se puede deber el sangrado? ¿Por la pastilla? ¿O por un sangrado de implantación? Se me hace muy pronto para un sangrado de implantación. Y no creo porque no eran los días fértiles de mi novia. A ella su ciclo le duran 42 días aproximadamente o sea que sus días fertiles son del 17 al 23 de noviembre. Alguien me podría contestar de manera honesta y sin burlas. Estoy asustado.