Estoy de baja y en mi nomina no lo refleja

Mi caso es que después de 13 años en mi empresa, cogí una baja por enfermedad que duró 8 meses, mi sorpresa es que a la vuelta me invitan a irme haciendo un pacto con ellos donde no salgo para nada beneficiada, yo por supuesto no lo acepté y entonces empezaron a hacerme la vida imposible, cambiando mi equipo de trabajo, categoría, mi lugar de trabajo.. Todo esto acabó hace poco en una baja por ansiedad. El hecho es que cogí la baja a mediados de mes, pero en mi nomina no lo refleja, y pone una cantidad en concepto de pago de empresa que nunca antes lo había puesto. ¿A qué puede ser esto debido? ¿Están haciendo alguna infracción al no reflejar mi baja en la nómina?