Partes de confirmación y alta por enfermedad común

Me encuentro de baja en mi empresa, por la seguridad social, por enfermedad común. Es la primera vez que me encuentro de baja y ando un poco perdida. Me surge una duda acerca de los partes de confirmación. Ayer miércoles fui a mi médico y me dijo que continuaba de baja, pero que no me tocaba parte, que me tocaba el viernes (con lo cual no sé para qué me hizo ir ayer). Pero me dijo que pidiera cita para el lunes de la semana que viene. Creo que el lunes me dará el alta, ¿pero si el parte me tocaba el viernes y yo no voy hasta el lunes al médico tendré algún problema con mi empresa? No sé si me explico bien.