¿Qué pasa si renuncio de forma voluntaria a una licencia de obras por modificación de proyecto urbanístico?

Tengo una licencia de obras concedida para la realización de obra de remodelación de estructuras en ruinas y ampliación de una parte nueva. Ya están ejecutadas las obras de remodelación, pero respecto a la nueva estructura he decidido hacer unos cambios y tengo un nuevo proyecto con ocupación menor que el proyecto original. He solicitado nueva licencia presentando el nuevo proyecto, pero el Ayuntamiento me indica que debo renunciar a la licencia anterior para que me den una nueva o continuar con la actual y presentar la modificación del proyecto al final de la obra. ¿Qué es lo correcto? ¿Tendré algún problema si ejecuto el nuevo proyecto con la licencia anterior? ¿Qué implica la renuncia voluntaria de la licencia de obras?