Aguas verdes

Buenos días,
tengo una piscina de cloro salino de 45 m3, la depuro 10 horas a lo largo del día. El clorador lo tengo al 85% y se ha mantenido estupenda. La semana pasada salimos de viaje y cuando he llegado el fondo estaba verde. Al limpiarlo lo que he hecho es hacer que el agua se torne de ese color. Comprobé el nivel de cloro y lo tenia alto, aún así decidí añadir cloro de choque (200gr) y ponerla a depurar toda la noche y día. El nivel de cloro está por las nubes y sigue prácticamente igual. El problema es que vamos ya sólo los fines de semana y este ya la he tapado con lona. Mi pregunta ¿se recuperará el agua? ¿Solo por el hecho de dejar de bañarnos se pone mal el agua?
Gracias.