Help! Archivos Secuenciales en C /C++(PREGUNTA)

Lenguaje C.
¿Para cargar, dar de baja o modificar datos en un archivo, primero habría que ingresar los datos en un archivo(novedades.txt)con dichas acciones y luego con un programa incorporarlas a otro archivo (proveedores.txt) o puedo ingresarlas directamente ¿es mejor?
Por ejemplo:
proveedores.txt: 1,2,4,6
Novedades.txt:1 Baja, 3 Alta, 2 Modificación
Proveedores novedades
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Programa
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Prov actualizados listado