Hipoteca compra+reforma

Hola buenas. Mi mujer tenia un piso que compró en octubre de 2001 por 6,5 millones. En octubre de este año lo ha vendido por 20 millones y ha saldado una hipoteca que había sobre el piso de 5 millones. La semana que viene vamos a firmar la compra de una casa que nos cuesta 18 millones y que también se pone a su nombre. La casa es vieja y necesita rehabilitación por lo que vamos a hacer una hipoteca con La Caixa de 145000 euros para financiar los 5 millones que faltan para comprarla más los gastos y rehabilitarla. La hipoteca nos la hacen a nombre de los dos ya que ella con su nomina no alcanza el riesgo. La hipoteca, La Caixa la denomina "Compra+reforma" con lo que al momento de firmar nos adelantan 56000 euros para la compra y luego nos van dando el resto a base de certificaciones de obra hasta llegar a los 145000. La cuestión es ¿cómo nos afecta toda esta operación ante Hacienda?. ¿Podrá mi mujer deducir el importe integro de la hipoteca o solo el de la compra?. ¿Nos conviene escriturar algo en negro de la compra? ¿Y de la rehabilitación, debemos justificar todos los gastos ante Hacienda o es preferible hacer también trabajos en negro?
Perdona por la extensión de mis preguntas pero quería dejarte lo más claro posible todos los conceptos. Gracias de antemano por tu atención