Bebé de 3 meses con caquita con mucosidad

Les cuento... Tengo un bebe de 3 meses y hace 1 mes defeca líquido y con mucosidad varias veces al día(antes defecaba con textura pastosa y color mostaza y 1 vez al dia), el tiene lactancia mixta y lo lleve a dos pediatras gastroenterologos y le cambiaron la leche de fórmula a Nutrilon pepti junior y además me hicieron hacer dieta libre de proteína de vaca (aplv), pero mi bebe no ha mejorado. El esta bien de ánimo, nunca tuvo fiebre ni malestar ni sangre en su caquita ni vómitos, solo caquita con moco y se le hizo una pequeña fisura en su ano... ¿alguien sabe si el moco en su caquita puede deberse a otra cosa y no a una alergia a la proteína de vaca?