La creación de una sociedad siempre conlleva más gastos que darse de alta como autónomo, ya que son necesarios más trámites notariales, registro, aportación de capital, llevanza de contabilidad... y por supuesto también tendría que estar dado de alta como autónomo administrador, siendo la cuota de este superior.
En cuanto a si desea iniciar la actividad como autónomo, sería darse de alta en Hacienda y seguridad social, y a funcionar.
En cuanto a las posibles bonificaciones en la cuota, si usted no ha estado de alta como autónomo en los últimos 5 años (aún estamos a la espera de la entrada de la reforma de autónomo y este tiempo bajara a 2 años) podrá beneficiarse de la llamada tarifa plana( 6 mese 50€, 6 siguientes sobre los 138€ Y otros 6mese 193€...). Para esto no puede tener deudas con seguridad social ni con Hacienda, las deudas con entidades privadas no influyen.
Es posible que también haya algún tipo de ayuda o subvenciones en su comunidad.
En cuanto a lo de "estimación directa o facturación" entiendo que se refiere a si acoge a módulos o no, la actividad de reformas no entra dentro de Módulos, por lo que tendrá que estar en estimación directa (ingresos-gastos)