Dada la siguiente secuencia Glu-Asp-Glu-Glu-Gly-Tyr-Asn-Cys-Cys-Val-lle-Ala-Pro-Ala-Trp-Met-Gly-Cys-Ser-Asn-Arg-Lys-Arg ...
Dudas de bioquímica.
¡Hola!, no se cómo resolver los siguientes apartados. ¡Muchas gracias!
A Indica las partes polares y apolares de esta proteína.
B Señala 2 residuos que establezcan puentes de hidrógeno con el agua y dibuja esta interacción.
C Indica la carga eléctrica de la proteína a pH = 7.
D A pH = 7 esta proteína tiene afinidad por un tetrapéptido básico. Indica qué tramo de la proteína interacciona con el tetrapéptido básico y el tipo de interacción.
E Cuando se acidifica el pH del medio se observa que la proteína ya no es capaz de realizar su función. Da una explicación razonada a esta observación.
F Indica un aminoácido que pueda fosforilarse y señala mediante qué tipo de enlace puede hacerlo. ¿Varía la carga de la proteína cuando está fosforilada?
G Indica el producto de degradación después de que actúe una proteasa que hidrolice los enlaces peptídicos solo cuando el grupo amino del enlace lo aporta un aminoácido aromático
H Sabiendo que los valores de pKa de los grupos ionizables de las cadenas laterales de los aminoácidos básicos son cercanos a 10, los de los aminoácidos ácidos cercanos a 4 y los valores del grupo fosfórico son pKa1 = 1y pKa2 = 6. ¿Cómo será el pI de la proteína fosforilada, mayor, menor o igual que 7?