No hay problema, si lo hechas correctamente. Normalmente el aguafuerte suele tener ácido clorhídrico al 17%. Si te fijas en las etiquetas de los reductores de PH veras que o llevan ácido clorhídrico o ácido sulfúrico.
Lo único que has de tener en cuenta es no mezclarlo al mismo tiempo con lejía o hipoclorito sódico puesto que ambos compuestos juntos provocarían una reacción toxica. Ello no quiere decir que no se puedan echar ambos productos a la piscina si no que ha de hacerse por separado.
La mejor forma de añadir el agua fuerte o ácido clorhídrico es diluir la cantidad necesaria en un caldero/regadera de agua e ir esparciéndolo por todo el borde de la piscina con la depuradora en marcha.