Bien, el cuadro clínico que detallas aparenta ser "Hemospermia", aunque también puede ser una infección.. Lo marrón es por que hay sangre vieja mezclada con el semen.. esto puede tener justamente 2 causas.. hemospermia y esto se debe a una inflamación en la próstata que hay que ver que la causa ( Puede ser desde una bacteria hasta una obstrucción), o puede ser una infección viral, ya sea por relaciones sexual es o mala higiene..
Hay medicación y antibióticos para ambos casos que solucionaran tu problema..
Pero es importante que no dejes pasar más tiempo, debes acudir a una consulta con un Urólogo profesional lo antes posible para descartar que no halla ningún problema en la próstata y que te recete el medicamento adecuado.