Estando en Guadalajara supongo que pertenecerá a la C.H. del Tajo. Aquí tienes las condiciones de autorización de dicha confederación para las obras realizadas en zona de policía (la franja de 100 m de la que te hablaba):
http://www.chtajo.es/Servicios/Tramitaciones/Documents/obraz_r1.pdf
Si tu edificación está claramente dentro de esta franja deberás solicitar autorización y realizar un estudio hidráulico. Si esta sobre los 100 m deberías ponerte en contacto con ellos para que te indiquen hasta donde te afecta esta franja.
Si necesitaras apoyo técnico o estudio hidrológico y lo consideras oportuno, puedes escribirme a [email protected] para establecer un contacto.
En caso de que el cauce del que me hablas perteneciera a la C.H. del Ebro, puedes encontrar la información en su web, pues no me permite ponerte en enlace a los requisitos de la autorización de obra en zona de policía.
Ruego cierres y valores si con esto queda contestada tu pregunta, si no, no dudes en preguntarme y, si necesitas asesoramiento más concreto, podemos contactar como ya te he dicho en [email protected] .