Registro Mercantil

Buenas,
Me han traspaso la contabilidad de una empresa. Y Me he dado cuenta que el CIF que consta en el Registro Mercantil es incorrecto. Según el registro el CIF es el que constaba en las escrituras iniciales, y desde la empresa me indican que es debido a que antiguamente solo había SA con la letra del CIF "A".
Y al cambiar posteriormente a SL se paso al mismo CIF con la letra "B".
¿Se ha de informar al registro del cambio? ¿Qué pasaría con todos los libros legalizados a posteriori del cambio?
Gracias de antemano