Amortizacion de prestamo s.l.

Hola, soy socio de una s.l. Y queremos amortizar parte del préstamo hipotecario que tenemos sobre el local. Tenemos unos ahorros a nivel privado y queremos saber si tenemos que formalizar un préstamo o si tenemos otra fórmula para poder hacerlo como una factura por el importe y justificar ese ingreso. Creo que no nos afectaría a nivel fiscal ya que la sociedad esta en perdidas. Gracias