Memoria depositada en RM errónea.

Te voy a dar mi opinión personal, de lo que haría en tu caso. Por experiencia te puedo decir que el contenido de la memoria no tiene carácter tan vinvulante como debería. Si ese tipo de pérdidas no se ha reflejado en la memoria, no lo considero tan importante como para modificar el depósito. Probablemente en 5 años no tengas una inspección y ese dato se quedará en el anonimato. En el caso de que la tuvieras, si puedes demostrar realmente esa pérdida con informes de peritos, etc., no creo que tengas problemas por no haberlo reflejado en la memoria. Pero ya te digo, esa es mi particular visión del tema.
Por otro lado, si modificas la memoria, deberás volver a presentar todas las cuentas anuales completas, porque forman un todo y no se pueden presentar de forma separada a no ser que el RM observe un error en la memoria y te permita subsanarlo por separado.