A ver, los errores en contabilidad, una vez realizadas las declaraciones de impuestos, cuestan dinero.
Me explico: la manera correcta de solucionar cualquier error contable es rectificar el asiento que se hizo mal, dejando los datos correctos en la fecha del asiento, y presentar las declaraciones complementarias de impuestos que toquen.
En tu caso, ese exceso de amortización significó un gasto declarado de más, que debió ser contabilizado de menos, y por lo tanto un Impuesto de Sociedades erróneo, falseado, que tocaría rectificar. Así es como deberías hacerlo.
Pero eso no te dejarán hacerlo así, so pena de perder tu empleo. Porque rectificar el IS significa una sanción y, casi seguro, una comprobación de oficio por parte de la Agencia Tributaria.
¿Qué haría yo? Corregir ese exceso contra amortizaciones que sí tengas que hacer este año. No veo otra manera de hacerlo.