Baja laboral

Tengo contrato indefinido desde hace casi un año, llevo dos meses si cobrar la nomina, pues la empresa a desaparecido sin dar explicación, aun no he denunciado, pero estoy en ello, por un problema de salud me tienen que operar y mi pregunta es si cojo la baja, aunque la empresa no tiene ni mutua ni nada, ni tengo donde presentar los partes de baja, si me paga la seguridad social, porque es una baja de más de 6 meses con recuperación incluida, a quien paga la seguridad social a la empresa o directamente a mi, y donde debería entregar los partes de baja . Gracias un saludo