Por principio de cuentas el trotar 9 km es la forma mas infame de perder el tiempo si lo que quieres es mejorar ti apariencia física. Gastas muy pocas calorías, exiges muy poco a to sistema cardiovascular y no ayudas a preservar o construir masa muscular.
Le llaman calistenia a los ejercicios con solo el peso de tu cuerpo y efectivamente muchos andan pregonando que construyeron buenos cuerpos con este sistema, pero hay que ser persistente y esforzarse para llegar a buenos niveles de acondicionamiento físico para lograrlo (un ejemplo de esto es llegar a hacer por lo menos 5 dominadas a una mano o ser capaz de hacer las sentadilla a una pierna "pistol squat") Los principales ejercicios (con muchas variaciones cada uno de ellos) son las sentadillas (squats), las zancadas (lunges), las flexiones de brazos (push-ups), las dominadas (pull-ups) y los ejercicios isométricos como las planchas (planK).
Hay una enorme cantidad de información en internet. Busca "entrenamiento con solo el peso corporal" o "bodyweight workouts".
En lugar de correr entrena con los cortos y efectivos entrenamientos que están ahora muy de moda, los "entrenamientos de resistencia metabólica" o "metabolic resistance training"
Te recomiendo lo siguiente:
Lunes. Miércoles y viernes. Entrenamiento de fuerza para todo el cuerpo (no mas de 30 minutos) y al final entrenamiento de resistencia metabólica de no mas de 15 minutos.
No se te olvide calentar al principio y hacer ejercicios de flexibilidad al final.
Martes, jueves y sábado. Ejercicio recreativo ligero . Puedes seguir corriendo pero una actividad que movilice mas articulaciones es mejor.
Domingo. Descanso.
La pregunta del horario es muy compleja y tiene que ver con múltiples factores siendo el mas importante la cantidad de alimentos que consumes y en que horarios. Sin conocer esa información y tomando en cuenta que dices sentirte débil en ayunas te recomiendo que tomes un alimento ligero una hora antes de entrenar. Leche, avena y fruta es una buena opción.