Reinvertir venta vivienda habitual en una cooperativa.

A finales del año 2000 compré un piso en la provincia de Lugo por un valor 48000 euros, donde residía parte de mi familia, y el cual estuve desgravando como vivienda habitual, pese a vivir en La Coruña, ya que por razón de mi trabajo (Militar), estoy obligado a residir en en el lugar de mi destino, dicho piso lo tenía pensado ocupar en cuanto cesase en mi puesto de trabajo, pero han cambiado mis circunstancias personales y decidí comprar un piso en La Coruña (en régimen de cooperativa) y vender el otro con la intención de reinvertir la ganancia del mismo en este nuevo piso, pero actualmente se me dan las siguientes circunstancias:
-Compré la primera vivienda en noviembre de 2000, para lo cual pedí un préstamo hipotecario, y por el cual he estado desgravando como vivienda habitual hasta el ejercicio pasado 2009.
-El año pasado me apunté a la cooperativa que os cité, efectuando un pago de 21200 euros en el 2009 y otro de 14000 en enero de este año, para lo cual tuve que pedir un préstamo de 24000 euros (en mayo del año pasado), al no disponer de la totalidad del dinero, poniendo a la venta el otro piso en el momento de apuntarme a la cooperativa.
-El mes pasado conseguí vender el otro piso por 84000 euros, de los cuales 39000 fueron destinados a liquidar la deuda hipotecaria que me quedaba, y el resto es el que me siembra las dudas, pues mi intención es reinvertirlo en mi nueva vivienda, pero no está previsto que estén finalizadas al menos en unos cuatro años.
-Tenía la intención de liquidar el préstamo que pedí el año pasado para hacer frente a los pagos que os cité anteriormente, del que me quedan 21000 euros, pero no sé si sería considerado como reinversión en mi nueva vivienda habitual, pese a que poseo los justificantes de la cooperativa de las aportaciones realizadas.
-Me gustaría saber si cancelando el préstamo que os cito se puede considerar que he reinvertido en mi nueva vivienda.
-En caso contrario, si deposito ese dinero en una cuenta vivienda hasta que finalicen los pisos, estaría exento de pagar la ganancia patrimonial que me correspondiese, que según las cuentas que he realizado anda por los 25000 euros aproximadamente.
-Os agradezco de antemano toda la información que me podáis dar sobre esta cuestión, que para mí es bastante compleja.
Gracias.

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