1) Si tienes contrato con la empresa y quieres solicitar la extinción con indemnización de despido improcedente (debes tener retrasos continuados de cierta cuantía, o 3 meses seguidos sin cobrar) ve directamente por la vía judicial solicitando también los pagos que te adeudan. Primero habría intento de conciliación, si la empresa no se presenta o no hay acuerdo se iría ya al Juzgado.
2) Si solo quieres reclamar los pagos debes presentar reclamación de cantidad en el SMAC y si no paga presentar la reclamación de cantidad en el Juzgado.
3) Si utilizas la ITSS para denunciar debes no iniciar las demandas en otras administraciones para no paralizar la actuación de la ITSS.
Si quieres acabar el contrato vete a la primera opción.
Si quieres seguir en la empresa lo mejor es la 2ª opción.
Utilizar la vía de la ITSS igual no te conviene para lo que quieres.