¿Qué se considera coste salarial y cuál no?

Creo que estas un poco liado, ya que los costes, no tienen nada que ver, con las partes del salario que cotizan y tributan o no, que un concepto como herramientas no cotice o no tribute en nómina, nada tiene que ver para que salga de tu bolsillo, es un coste menos caro por que no tiene cargas sociales pero no deja de ser un coste para la empresa.
Debes sumar el bruto de todas las nóminas, con independencia de donde estén, cada una de las cantidades, ya que tú gasto es el bruto de cada una, luego les aplicaras los descuentos de S.S., y de IRPF, y al trabajador le darás menor cantidad pero ese descuento que te quedas luego lo pagas a S.S., cada mes vencido, y trimestralmente a hacienda (mod. 111).
Al bruto de cada nómina mas la parte de la empresa de S.S., es el Coste Salarial, la parte de S.S., de la empresa para que no te líes, ya que en los boletines va todo junto, empresa y trabajadores, se lo puedes pedir a quien te confeccione las nóminas y los S.S.
El Coste no salarial, yo entiendo los medios, menos los trabajadores, que empleas para poder hacer la obra (maquinaría, materiales, seguros (menos los relativos a los trabajadores que sería coste salarial), etc..)
Como indicas las cuatro últimas no tienes que tomarlas, ya que son del trabajador, no es un coste para la empresa, salen del descuento en su nómina, además están incluidos en los Seguros Sociales.