Si coges la baja y sigues vinculado a la empresa, es decir mientras sigas con el contrato de trabajo en vigor, la empresa seguirá cotizando a la seguridad social y al SEPE para la cobertura del desempleo, de forma que estando en situación de IT mientras sigas vinculado a la empresa ademas de no consumir ningún día la prestación por desempleo seguirás acumulando cotizaciones para cuando las necesites en un futuro.. Pero si después de coger la baja te despiden de la empresa el INSS o la mutua dependiendo de con que entidad tenga concertada la empresa la cobertura por incapacidad temporal te seguiría pagando la prestación por IT hasta que se produzca el alta medica pero cuando vallas a solicitar el tiempo que te corresponda del paro te encontraras con que el SEPE te va a descontar de los días del desempleo todos los días de permanencia en situación de IT desde la fecha de la extinción del contrato de trabajo o despido hasta la fecha del alta medica.. De todas formas en el siguiente enlace del SEPE te lo explica de forma clara y sencilla.. Si no necesitas ninguna aclaración, no se te olvide calificar la respuesta pulsando las estrellitas amarillas que se encuentran debajo de la pregunta para que me puedas volver a consultar otra vez .. Gracias y un saludo..