Consideración de vivienda habitual

Según la legislación vigente, se entenderá que el contribuyente está transmitiendo su vivienda habitual:
1.- Cuando la vivienda que se transmite, constituya su vivienda habitual en el momento de la venta o hubiera tenido tal consideración hasta cualquier día de los dos años anteriores a la fecha de transmisión.
2.- Cuando la vivienda que se transmite hubiese dejado de ser vivienda habitual por haber traslado el contribuyente su residencia habitual a la nueva vivienda en cualquier momento posterior a su adquisición.
Según me expones, la vivienda que compró tu esposa y en la que estuvo viviendo 3 años, hace 5 años que no la ocupa y no figura como su residencia habitual, por lo tanto no cumple la primera condición, ni tampoco la segunda obviamente, por lo tanto, no podría acogerse a los beneficios fiscales por reinversión de vivienda habitual, siendo la transmisión de la misma asimilable a la ganancia patrimonial que se obtendría por la venta de una segunda vivienda u otro inmueble. En cambio, sí que podréis acogeros a la deducción por inversión en vivienda habitual, con los límites que marca la Ley, porque en tu caso no has tenido antes ninguna vivienda y en el caso de ella, si se la dedujo en su día, por la diferencia entre el valor de la nueva vivienda y lo que se dedujese en su renta por la anterior.

Entonces, en caso de que ella se volviera a empadronar en su vivienda, antes de adquirir una casa nueva, cumpliría los requisitos aunque no llevase vivviendo en ella más de 3 años consecutivos, habiéndolo estado ya con anterioridad. ¿No se podría acoger a la exenciones por motivos laborales o matrimonio? Y en caso negativo ¿se podría justificar la residencia con facturas tipo gas, comunidad, agua, etc..., y no necesariamente con el justificante de empadronamiento?, gracias por la aclaración anterior.

NO, la Ley tiene esto en cuenta. Debería de empadronarse y vivir en ese piso, al menos tres años. Solo si el piso fuera nuevo o recién adquirido, sería sufici ente con estar empadornada solo 12 meses.
Si tenéis pensado adquirir el piso a corto plazo, no os podréis beneficiar de la exención por reinversión. Si el proyecto es a largo plazo, puede empadronarse ella y venderse dentro de tres años, pero claro, dada la situación de le economía española, nadie te garantiza que estas medidas fiscales no cambien en el futuro y dentro de tres años, la presión fiscla sea mucho mayor.

Por lo que me dices, ¿sólo puede justificarse la residencia en una vivienda, con el certificado de empadronamiento?, en el inmueble que estamos residiendo ahora es propiedad del estado, es decir; lo pone el estado a disposición de sus funcionarios por motivos laborales y por el cual no pagamos alquiler (sólo gastos), ¿no se podría alegar vivir en éste por cercanía al puesto de trabajo (motivos laborales) y seguir haciendo uso del piso en fines de semana y tiempo libre, aún sin figurar empadronado en él, ya que es el único inmueble que consta a nombre, de uno de la unidad familiar?, perdona que te siga bombardeando con preguntas que parece haber fomurlado ya, pero quiero que me quede bien claro, y saber que posibilidades hay de que hacienda no se quede con el 18% de mi dinero, ya que me imposibilita adquirir una nueva casa, y sinceramente me parece un abuso, gracias de nuevo.