El proceso que quieres realizar es bastante peliagudo y tienes que ir con mucho cuidado. Si esas tablas tuvieran relaciones con otras ya te digo que ni lo intentes, dado que se podría montar un "pitote" de cuidado. El hecho de poner un identificador para cada BD mejoraría la situación, pero deberías asegurarte de que todas las relaciones cuelgan de ese identificador por sucursal.
Simplificando un hipotético ejemplo, suponiendo que te interesa la información de una tabla llamada TDatos, lo que podrías hacer (pero es bastante manual) sería:
1.- Te creas una carpeta "fija" (es decir, que no se modifique su ruta) y ahí metes todas las BD's que te envíen. Si ya están pues las machacas y listo. Eso sí, cada BD debería tener un nombre representativo. Por ejemplo, BDSucursal1, BDSucursal2, etc.
2.- En tu BD creas la tabla TDatos, igual al resto, pero sólo en su estructura. Si tienes algún id autonumérico conviértelo simplemente a numérico (al tener que hacer esto es por lo que te comentaba que si tienes relaciones todas se iban al garete")
3.- Vincula (no importes) la tabla TDatos de BDSucursal1, BDSucursal2, etc. Este paso sólo lo tendrías que realizar la primera vez, de ahí que sea necesario que las BD's estén en una ruta "fija", porque si no tendrías que revincularlas cada vez.
4. Créate una consulta en blanco (sin basarte en ninguna tabla) y ponla en vista SQL. Supongamos que la llamas CUneTablas. En ella escribe la siguiente SQL:
SELECT * FROM TBDSucursal1
UNION
SELECT * FROM TBDSucursal2
UNION
SELECT * FROM TBDSucursal3
Y así con todas las sucursales que tengas.
5.- Créate una consulta basada en CUneTablas, llamémosla CTraspasaDatos, y conviértela en una consulta de inserción de datos.
6.- En un formulario, con un botón de comando, en su evento al hacer clic le generas el siguiente código:
...
Private Sub...
Currentdb.execute("DELETE FROM TDatos")
Docmd. Openquery "CTraspasaDatos"
msgbox "Hecho"
End sub
...
Y con esto puedes recoger los datos de todas las tablas en una, siempre teniendo presente que la hipótesis de partida era que manejabas una sola tabla que contenía la información relevante.
Insisto que si tienes relaciones entre tablas el proceso se complicaría bastante, por no decir que sería imposible hacerlo (por los Id's duplicados).