¿Mi periodo puede llegar solo con manchas cafés?

Hola, estoy usando Nofertyl como anticonceptivo y me he inyectado ya por 3 ves, pero días antes tuve relaciones y mi periodo llego solo como manchas café. ¿Esto sera algún síntoma de embarazo? Me hice una prueba de farmacia y salio negativa pero he venido presentando dolores en el vientre. Estoy un poco asustada.
Podrían ayudarme. Gracias