Factura con iva incluido

Eso depende de que tipo de gasto es.
Debo hacerte un aclaración, en tu pregunta no dices esa factura porque concepto fue. El manejo del IVA tiene varias connotaciones, cuando la factura es por un concepto relacionado con la
generación de renta, es decir, para que se generara renta fue necesario incurrrir en un gasto, o
esta factura corresponde a materia prina o insumos para el normal desarrollo de la empresa, entonces procede lo que tu dices, separar el IVA del valor de la factura, y lo contabilizas
independientemente, ahora si es un gasto no relacionado con la generación de renta o ingresos, no es necesario que hagas ese desglose, simplemente llevalo como un mayor valor del gasto, si es un gasto claro está, esto se debe a que el IVA puede o no ser deducible o descontable, es decir puedes deducir el valor del IVA o imputarlo a los ingresos o lo que es lo mismo te le acepten como gasto, de esta forma el valor del IVA disminuiría el ingreso, redundando en una menor utilidad, que a la vez significa un menor impuesto a pagar, pero eso no significa que la empresa tenga menos ingresos, al contrario, significa un pago menor de IVA, una recuperación de este valor en un 35 o 40 por ciento dependiendo del porcentaje de impuesto que se paga a la renta
Ahor si el IVA de la factura lo puedes descontar del IVA por pagar sería mucho mejor, recuperarías ese valor en un 100% y a un plazo más corto.
Otra opción es llevar el valor del IVA como un mayor valor del gasto, activo, o materia prima que corresponda.
Si te ha quedado alguna duda, aquí estaré para tratar de ayudarte.