Mi novia me quiere pero necesita estar un tiempo sola

Hola,
Para empezar decir que mi novia lleva mucho tiempo sometida a mucha presión y estrés, por cuestión de estudios y trabajo. A medida que el estrés fue aumentando la veía más tensa y con menos ganas de hacer cosas. Un día, hace ya bastantes meses, teniendo relaciones, sintió mucho dolor y desde entonces no ha sido capaz de volver a tenerlas. Yo no la he presionado, ni siquiera lo he intentado, pero se unió una razón más para aumentar su estrés. Por cuestiones de trabajo estuvo varios meses fuera en los que solo nos veíamos los fines de semana y a ratos porque se tenía que pasar la mayor parte del tiempo estudiando. Durante ese tiempo, aunque seguía sin tener ganas de tener relaciones, yo la veía más animada el tiempo que estábamos juntos, aunque estaba realmente agotada.
Pasados unos meses, antes del verano volvió a casa, y tras un tiempo de vacaciones con su familia, volvimos a pasar más tiempo juntos, poco a poco se iba agobiando más cuando estaba conmigo y estaba más triste, y a raíz de un problema de salud se ha venido abajo del todo. En todo este tiempo yo no la he presionado para tener relaciones, y no hemos discutido en este tiempo (no más de lo normal en una pareja).
Ahora me dice que necesita estar sola un tiempo, que se agobia mucho cuando esta conmigo, que ve a otras parejas y se agobia más porque le gustaría estar como ellos y no puede. Que yo soy maravilloso, pero que no sabe que le pasa que parece que no tiene ilusión.
Yo he aceptado darnos un tiempo, pero tengo mucho miedo de que luego vea que está mejor sin mí, para hacérselo más llevadero la dije que no la llamaría (y eso para mí esta siendo una tortura), que esperaría que me llamase ella cuando quiera, pero tampoco sé si es lo correcto. Y lo que más me preocupa de todo es que no se como ayudarla. ¿Qué puedo hacer?